Sci Rep：5-miRNA标签构造可作为食管鳞状细胞癌的预后生物标志物

2021-11-22 07:23:54 来源:

这项研究旨在未确定一种可以计算食管鳞状细胞癌（ESCC）患者相比之下成功率（OS）的miRNAs标签。

从NCBI GEO获得119名ESCC患者的miRNA表达著者及其相应的临床信息，并将其作为基础训练集。在现代和晚期试样间配对差异性表达的miRNAs（DEmiRNAs）。使用Cox回归量化、递归相似性消除（RFE）-支持向量机（SVM）算法和LASSO Cox回归模型来辨识病因性miRNAs，从而创建病因低分模型。此外，计算了这些病因性miRNAs的有前途靶蛋白质，然后重构了miRNA靶蛋白质网络。通过功能富集量化，量化了ESCC之前这些病因性miRNAs计算靶蛋白质的功能相关性。

在基础训练分散，现代与晚期试样有46个DEmiRNAs。创建了基于5个miRNAs的后果低分模型。该5-miRNA后果低分可以将基础训练集分为OS间隔时间明显有所不同的高危组和低危组。在一个来自帕金森氏症蛋白质组图著者（TCGA）的独立数据分散，成功正确性了5-miRNA后果低分的后果由上而下意志力。尚未有了与这些miRNAs相关的各种微生物学处理过程和自营，例如Wnt回波自营、TRP入口的炎症介质调节自营和雌激素回波自营。

这项研究上会，与组织学应于相关的5-miRNA标签对计算ESCC患者的病因具有临床意义。

原始原文：

JunYu. Characterization of a five-microRNA signature as a prognostic biomarker foresophageal squamous cell carcinoma. Sci Rep. 27 December 2019.

本文系雷纳医学(MedSci)原创PHP整理，转载需授权！