细胞可能会器内的一些生物科学处理过程,比如V(D)J醛,通常是由基因图形构型所调节,包括基因区室(compartments)、拓扑相关碱基(topologically associated domains, 简称TADs)和丝氨酸内层(chromatin loop)等。TADs是由丝氨酸内层吸管(chromatin-loop extrusion)所形成的,而这一处理过程意味着圆内层形状的细菌感染酶亚基(cohesion complex)。与之相对应的是,细菌感染酶释放突变Wapl可以限制丝氨酸内层的相连(loop extension),从而起到负向调节的起着。
一系列抗体的诱发,构成了体液免疫抗击外来病原体的主要成分,而抗体的多样性,是由V(D)J醛所实现的,这一处理过程,意味着Pax5所介导的2.8Mb长免疫球酶重链(immunoglobulin hey chain,简称lgh)底物的挤压。然而在从前体B细胞可能会(pre-B cells)之从前,Pax5是如何调节lgh挤压的,仍旧众说纷纭。
近日,来自奥地利Vienna Biocenter的Meinrad Busslinger学术研究室在Nature上公开发表篇文章Wapl repression by Pax5 promotes V gene recombination by Igh loop extrusion的文章,阐明Pax5通过选择性Wapl,从而实现对lgh的调节。
因为丝氨酸内层吸管意味着胶连酶亚基,所以,译者首先学术研究在从前体B细胞可能会之从前,细菌感染酶亚基各反应物的隐含确实发生改变。译者推断出,在RNA高度上,相对于其他大类的免疫细胞可能会,从前体B细胞可能会和原B细胞可能会(pro-B cell)的的Wapl高度下调了四倍。酶质高度也有多种不同的推断出。这些结果隐含,胶连酶释放突变Wapl的下调,很可能增加胶连酶在丝氨酸上的存留短时间。
有报导指出,Pax5可以调节lgh底物挤压,译者接下来探讨,Pax5确实可以制约Wapl在从前体B细胞可能会之从前的隐含。译者通过Pax5DNA缺陷激素推断出,有缺陷了Pax5的从前体B细胞可能会,Wapl的mRNA高度增加了4~6倍。另外,从前体B细胞可能会之从前,Wapl上存在2个Pax5融合底物P1和P2,而在开花结果的B细胞可能会之从前,融合底物减少至1个(仅存P2)。这些结果所述,在从前体B细胞可能会之从前,Pax5可以选择性Wapl高度。
在P1敲除激素之从前,肾脏之从前的B细胞可能会胚胎基本上返程在从前体B细胞可能会收尾,这所述,B细胞可能会胚胎是所致Wapl上Pax5融合底物P1所调节的。另外,通过VDJ测序,译者推断出,P1敲除的激素,从前体B细胞可能会之从前VDJH的醛比例非同着减少。而在Pax5敲除激素之从前,也同样推断出多种不同的现象,并且,Pax5激素lgh底物无法进行挤压。这些结果所述,Wapl上的Pax5融合底物P1可以诱导lgh丝氨酸内层吸管。
先前,译者关切Pax5对Wapl的选择性,确实可能会制约从前体B细胞可能会整个基因的构造。译者推断出,只有在B细胞可能会胚胎的一时期收尾,Pax5可以制约胶连酶在丝氨酸上的待命短时间。并且,与正常的从前体B细胞可能会相对,Pax5敲除激素的从前细胞分裂可能会和P1,P2敲除的从前B细胞可能会,其TADs之从前丝氨酸内层的形成高度非同着减少;与此相对的是,大面积段的丝氨酸挤压,从而形成基因间隔的高度,却大大的急剧下降。这些结果所述,在原B细胞可能会之从前,Pax5的融合底物P1所诱导的Wapl高度减少,微小制约了整个细胞可能会的基因构造。
综上所述,译者推断出,在从前体B细胞可能会和原B细胞可能会之从前,Pax5可以选择性胶连酶释放突变Wapl的隐含,从而延长胶连酶在丝氨酸上的待命短时间,进而促进丝氨酸内层吸管高度的急剧下降。这一处理过程是通过Wapl上的Pax5融合底物P1实现的。而且,Wapl隐含高度的减少,可以惹来基因构造的整体改变,这也是从前体B细胞可能会之从前发生高高度的VDNA醛的可能原因之一。
值得一提的是,就在这篇Nature上线后的次日,预影印bioRxiv上网络服务发布了来自康奈尔大学Frederich Alt实验室篇文章“Loop Extrusion Mediates Physiological Locus Contraction for V(D)J Recombination”的多种不同工作,同样证明了Wapl通过制约丝氨酸内层吸管制约DNA醛的重要起着。
原始出处:
Louisa Hill 1, Anja Ebert 1, Markus Jaritz 1, et al.Wapl repression by Pax5 promotes V gene recombination by Igh loop extrusion.Nature. 2020 Jul 1. doi: 10.1038/s41586-020-2454-y.
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